Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Xirp1O70373 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xirp1O70373 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xirp1O70373 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xirp1O70373 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xirp1O70373 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xirp1O70373 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Xirp1O70373 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Xirp1O70373 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms