Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ptpn20O55082 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ptpn20O55082 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms