Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copb2O55029 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms