Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffaO54786 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffaO54786 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffaO54786 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffaO54786 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffaO54786 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffaO54786 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DffaO54786 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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