Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CrxO54751 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CrxO54751 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CrxO54751 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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