Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Phox2bO35690 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Phox2bO35690 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phox2bO35690 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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