Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RaxO35602 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RaxO35602 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RaxO35602 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaxO35602 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaxO35602 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaxO35602 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaxO35602 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RaxO35602 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms