Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clk2O35491 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Clk2O35491 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Clk2O35491 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Clk2O35491 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clk2O35491 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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