Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Prrt1O35449 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Prrt1O35449 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Prrt1O35449 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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