Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Casq1O09165 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Casq1O09165 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms