Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sypl1O09117 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sypl1O09117 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms