Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hps1O08983 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hps1O08983 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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