Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PbsnO08976 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PbsnO08976 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PbsnO08976 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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PbsnO08976 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PbsnO08976 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PbsnO08976 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PbsnO08976 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PbsnO08976 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PbsnO08976 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PbsnO08976 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PbsnO08976 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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