Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EllO08856 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms