Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MttpO08601 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MttpO08601 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms