Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm2888K7N746 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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