Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm5294J3QP53 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.2 ms