Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Gm20795J3QP49 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Gm20795J3QP49 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Gm20795J3QP49 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Gm20795J3QP49 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Gm20795J3QP49 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Gm20795J3QP49 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm20795J3QP49 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Gm20795J3QP49 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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