Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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