Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21976J3QNN2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21976J3QNN2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms