Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm21972J3QN38 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm21972J3QN38 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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