Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Top6blJ3QMY9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Top6blJ3QMY9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top6blJ3QMY9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top6blJ3QMY9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top6blJ3QMY9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top6blJ3QMY9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top6blJ3QMY9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top6blJ3QMY9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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