Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm6176J3QK59 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm6176J3QK59 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms