Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem200cJ3QK46 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem200cJ3QK46 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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