Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cldn34c3J3QJW5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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