Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vmn1r34G3XA52 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms