Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl26F8VQM2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms