Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Olfr169-203ENSMUST00000215476 2476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms