Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm8005F6YKY3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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