Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crocc2F6XLV1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Crocc2F6XLV1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms