Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn2r40F6W043 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms