Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28305F6U473 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28305F6U473 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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