Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh16f1E9Q9P8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms