Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms