Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pdzd2E9Q1M1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdzd2E9Q1M1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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