Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atad2bE9Q166 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atad2bE9Q166 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms