Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ddx60E9PZQ1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddx60E9PZQ1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms