Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ryr1E9PZQ0 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms