Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rsph10bE9PYQ0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms