Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3002E9PW72 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms