Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc175E9PVB3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms