Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clca3bE9PUL3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms