Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Soga1E1U8D0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms