Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms