Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms