Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm6685D3YYP3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms