Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rfx8D3YU81 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfx8D3YU81 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rfx8D3YU81 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfx8D3YU81 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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