Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm17333C6EQI3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms