Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms