Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apol7aB2RT54 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apol7aB2RT54 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms